FCヘリオス・タルトゥ(エストニア語: FC Helios Tartu)は、エストニアのタルトゥを拠点とするサッカークラブである。2010年に創設され、現在はメスタリリーガに参加している。

チーム名は、ギリシャ神話に登場する太陽神ヘリオスに由来する。クラブのエンブレムには、太陽とサッカーボールが描かれている。

FCヘリオス・タルトゥは、2010年にタルトゥ大学の学生によって創設された。クラブは、2011年にエシリーガ(エストニア2部リーグ)に昇格し、2013年にメスタリリーガ(エストニア1部リーグ)に昇格した。

メスタリリーガでの最高成績は、2017年の4位である。また、2013年にはエストニア・カップで準優勝を果たした。

FCヘリオス・タルトゥは、ホームゲームをタルトゥ・リンナスタディオンで行っている。スタジアムの収容人数は、2,500人である。

チームは、サポーターから「ヘリオス」と呼ばれている。クラブのマスコットは、太陽をモチーフにしたキャラクターである。