AFCウィンブルドン

ウィンブルドン地区には1899年創設のウィンブルドンFCというプレミアリーグの在籍・FAカップ優勝経験も持つ歴史あるクラブが存在していたが、安全性に問題のある立ち見席を廃したスタジアムを用意することをイングランドサッカー協会から求められており、1991年まで本拠地だったプラウ・レーン (en) からセルハースト・パークをクリスタルパレスFCと共用（グラウンドシェア）し、2002年まで使用していた。グラウンドシェアの解消をする為、クラブは2003年9月にミルトン・キーンズに本拠地を移転。2004年6月21日には正式にミルトン・キーンズ・ドンズFCに改称し、ウィンブルドンFCとしての活動を停止。これによりウィンブルドンFCを名乗るクラブは消滅した。一方、ウィンブルドン地区からの移転意向を発表したクラブに強く反対して激怒したサポーターにより、2002年にAFCウィンブルドンが設立され、地域リーグのコンバインド・カウンティーズ・フットボールリーグ（9部相当）からスタートした。2004年のウィンブルドンFCからミルトン・キーンズ・ドンズFCへの改称後は、旧来のウィンブルドンFCサポーターの大半は、ミルトン・キーンズ・ドンズFCはウィンブルドンFCの遺産と伝統を代表していないと感じてミルトン・キーンズ・ドンズへの支持を撤回し、AFCウィンブルドンをウィンブルドンFCのフェニックスクラブ(既存クラブの終焉後に、終了したクラブのサポーターによって新たに設立され、支持されているクラブ)として支持することとなった。

2002年から2004年まで足掛け3シーズンにかけてリーグ戦78試合連続不敗を達成しており、これはイングランドの全カテゴリーに所属する全フットボールチームの中での最長記録である。

2008-2009年シーズンにカンファレンス・サウス（6部相当）で優勝、カンファレンス・ナショナル（5部相当）への昇格を決めた後、2009-2010年シーズンの8位を経て、2010-2011年シーズンには2位に入り、昇格を賭けたプレーオフでルートン・タウンFCにPK戦で勝利し、フットボールリーグ2(4部相当）への昇格を決めた。