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1991年4月22日に創設された。1991年8月18日、ピメンタ・ブエノ（ポルトガル語版）で開催されたカンピオナート・ロンドニエンセ（ロンドニア州選手権）の試合にて、最初の公式戦をECオペラリオと行う（1-1の引き分け）。同年9月18日、セレジェイラス（ポルトガル語版）で開催されたECコロラドとの試合でクラブ初勝利を収める (3-1)。

同年12月15日、カンピオナート・ロンドニエンセ決勝でフェロヴィアリオ（ポルトガル語版）を破り、最初のタイトルを獲得した。ジ＝パラナのイタマルが大会得点王だった。

1992年、カンピオナート・ブラジレイロ・セリエCに初参加した。ジ＝パラナは第1ステージにおいてグループ最下位で敗退した。同年にはコパ・ド・ブラジルにも初参加し、第1ステージでグレミオに敗れた。

1995年、再びセリエCに参加し、準々決勝でアトレチコ・ゴイアニエンセに敗れた。1996年はセリエC第3ステージに進み、そこでアマゾナス州のナシオナルに敗れた。1997年はセリエCの第4ステージにおいてジュベントスに敗れた。 1999年、2002年、2004年、2005年にもセリエCに参加し、すべて第1ステージで敗退した。

2000年、コパ・ド・ブラジルの第2ステージに進出した。これはジ＝パラナにとって同大会における最高成績である。この年はバイーアに敗れた。

2007年、カンピオナート・ロンドニエンセで最下位に終わり、2部へと降格した。

2009年のカンピオナート・ロンドニエンセ2部決勝にて、ジ＝パラナはモト・クルーベ（ポルトガル語版）との第1試合に勝利したが、選手たちが報酬支払いをめぐってクラブと対立し、第2試合が行えなかった。地元のスポーツ裁判所の判断によりモト・クルーベがこの年の2部チャンピオンとされ、ジ＝パラナは昇格を見送られ、1年間の出場停止処分を受けた。